Новое исследование показало, что устойчивые к антибиотикам штаммы Klebsiella pneumoniae, условно-патогенного микроорганизма, который может вызывать инфекции дыхательных путей и кровотока у людей, распространяются в больницах Европы. Некоторые штаммы K. pneumoniae устойчивы к карбапенемным антибиотикам, которые представляют собой последнюю линию обороны при лечении инфекций, и поэтому считаются чрезвычайно лекарственно-устойчивыми (ШЛУ).
В ходе общеевропейского исследования семейства бактерий Enterobacteriaceae исследователи из Центра надзора за геномными патогенами при Институте Wellcome Sanger при Фрайбургском университете и их партнеры проанализировали геномы почти 2000 тыс. y образцы пневмонии, взятые у пациентов в 244 больницах в 32 странах. Результаты, опубликованные сегодня (29 июля 2019 г.) в журнале Nature Microbiology, послужат основой для усилий общественного здравоохранения по борьбе с распространением этих инфекций в больницах по всей Европе.
По оценкам, в 2007 г. 341 случай смерти в Европе был вызван устойчивыми к карбапенемам K. pneumoniae; к 2015 году количество смертей увеличилось в шесть раз до 2094. Большое количество смертей связано с тем, что, когда карбапенемы больше не эффективны против устойчивых к антибиотикам бактерий, остается мало других вариантов. Младенцы, пожилые люди и люди с ослабленным иммунитетом особенно подвержены риску.
Опрос является крупнейшим в своем роде и является первым шагом на пути к последовательному эпиднадзору за устойчивыми к карбапенемам бактериями в Европе. Более 2000 образцов K. pneumoniae были собраны у пациентов в 244 больницах и отправлены в Институт Велкама Сэнгера, где были секвенированы геномы 1700 из них.
Исследователи определили небольшое количество генов, экспрессия которых может вызывать устойчивость к карбапенемным антибиотикам. Эти гены производят ферменты, называемые карбапенемазами, которые «пережевывают» антибиотики, делая их бесполезными.
Обеспокоенность общественного здравоохранения вызывает недавнее появление небольшого числа клонов «высокого риска», несущих один или несколько генов карбапенемазы, которые быстро распространились. Считается, что интенсивное использование антибиотиков в больницах способствует распространению этих высокорезистентных бактерий, которые вытесняют другие штаммы, которые легче поддаются лечению антибиотиками.
Доктор София Дэвид, первый автор исследования, проведенного в Центре надзора за геномными патогенами, сказала: «Подход «Единое здоровье» к устойчивости к антибиотикам фокусируется на распространении патогенов через людей, животных и окружающую среду, включая больницы. Но в случае с Klebsiella pneumoniae, устойчивой к карбапенемам, наши результаты показывают, что больницы являются ключевым фактором передачи: более половины образцов, несущих ген карбапенемазы, были тесно связаны с другими образцами, собранными в той же больнице, что позволяет предположить, что бактерии распространяются от человека. личному в первую очередь в больницах."
Образцы устойчивых к антибиотикам бактерий также с гораздо большей вероятностью были тесно связаны с образцами из другой больницы в той же стране, а не из разных стран, что позволяет предположить, что национальные системы здравоохранения в целом играют важную роль в распространении инфекции. эти устойчивые к антибиотикам бактерии.
Несмотря на явную угрозу, которую устойчивые к карбапенемам K. pneumoniae представляют для пациентов, более эффективный инфекционный контроль в больницах, включая рассмотрение того, как пациенты перемещаются между больницами, и гигиенические мероприятия, окажут свое влияние.
Профессор Хайо Грундманн, соавтор и глава Института профилактики инфекций и больничной гигиены в Медицинском центре Фрайбургского университета, сказал: изоляция пациентов-носителей этих бактерий, мы можем не только задержать распространение этих возбудителей, но и успешно контролировать их. Это исследование подчеркивает важность инфекционного контроля и постоянного геномного наблюдения за устойчивыми к антибиотикам бактериями, чтобы гарантировать раннее обнаружение новых устойчивых штаммов и принятие мер по борьбе с распространением устойчивости к антибиотикам».
В настоящее время планируется второе исследование семейства бактерий Enterobacteriaceae в больницах Европы. Полученные данные доступны через MicroReact, общедоступный веб-инструмент, разработанный Центром надзора за геномными патогенами. MicroReact поможет исследователям и системам здравоохранения наметить распространение устойчивости к антибиотикам у таких патогенов, как K. pneumoniae, и отслеживать, как они развиваются.
Профессор Дэвид Ааненсен, соавтор и директор Центра геномного надзора за патогенами, сказал: «Геномный надзор будет ключом к борьбе с новыми видами устойчивых к антибиотикам штаммов патогенов, которые были выявлены в этом исследовании. В настоящее время, новые штаммы развиваются почти так же быстро, как мы можем их секвенировать. Цель создания надежной сети центров секвенирования генома позволит системам здравоохранения гораздо быстрее отслеживать распространение этих бактерий и их эволюцию».