Родившийся в диких условиях чистокровный австралийский пустынный динго по имени Сэнди Малики занял первое место в конкурсе «Самый интересный геном в мире». Предложение UNSW расшифровать ДНК Сэнди было одним из пяти финалистов гранта Pacific Biosciences SMRT Grant, который обеспечивает передовое секвенирование полного генома особенно интересного растения или животного.
Общественность определила победителя: двухлетняя Сэнди получила 41 процент голосов международного сообщества, за ней следуют храмовая гадюка, затем морской слизень на солнечной энергии, взрывоопасный жук-бомбардир и розовый голубь.
«Мы очень рады, что наша заявка на секвенирование ДНК Сэнди захватила воображение общественности», - говорит руководитель проекта, профессор Билл Баллард из Школы биотехнологии и биомолекулярных наук UNSW.
Сэнди - настоящий подарок науке. Будучи редким чистокровным динго, рожденным в дикой природе, она представляет собой уникальный пример. Чистокровные динго занимают промежуточное положение между дикими волками и домашними собаками, обладая рядом неприрученных черт. Таким образом, секвенирование генома Сэнди поможет точно определить некоторые гены темперамента и поведения, лежащие в основе перехода от диких животных к идеальным домашним животным.
«Кроме того, дополнительные знания о генетике динго помогут усилиям по сохранению этих замечательных австралийских животных за счет разработки улучшенных тестов на чистоту динго», - говорит профессор Баллард.
Сэнди, ее сестра и брат были обнаружены трехнедельными щенками в австралийской пустыне недалеко от трассы Стшелецкого в 2014 году любителями животных Нового Южного Уэльса Барри и Лин Эгглтон, которые с тех пор выращивают их вручную. Щенки были на грани смерти, а их родителей найти не удалось.
Проект определения последовательности динго будет первым, кто проверит теорию Чарльза Дарвина 1868 года о том, что процесс одомашнивания можно разделить на два этапа: бессознательный отбор в результате непреднамеренного человеческого влияния; и искусственный отбор в результате селекции людьми желаемых признаков.
«Этот проект покажет изменения ДНК между волками и динго (бессознательный отбор) и динго и собаками (искусственный отбор)», - говорит профессор Баллард.
Основной целью ежегодного международного конкурса PacBio, в котором в этом году приняли участие более 200 участников, является повышение осведомленности общественности о науке и о том, как геномные исследования могут принести пользу обществу. Команда Сэнди, создавшая страницу «Танцы с динго» в Facebook, заручилась поддержкой самых разных людей по всему миру, в том числе защитников животных и поклонников волков, динго и собак.
"Мы также взаимодействовали с сотрудниками и студентами Университета Нового Южного Уэльса, привезя двух чистокровных альпийских динго из заповедника Барго Динго в кампус для всеобщего ознакомления", - говорит профессор Баллард.
Передовая технология PacBio позволяет секвенировать ДНК в длинных участках, содержащих десятки тысяч оснований, а не в более коротких участках из нескольких сотен оснований, как в существующих методах. Это может выявить важные перестройки в геноме, влияющие на экспрессию генов.
Секвенирование будет проведено в Университете Аризоны, а первоначальный анализ будет проведен компанией Computomics в Германии.
В состав австралийской команды, стоящей за проектом Sandy, также входят профессор Клэр Уэйд из Сиднейского университета, доктор Ричард Мелвин из UNSW, доктор Роберт Заммит из ветеринарной больницы Vineyard и доктор Андре Миноч из Гарванского института медицинских исследований.
UNSW имеет прочную репутацию в области исследований геномики: ученые из университетского Центра геномики Рамачиотти работали над геномами множества других важных местных существ, включая коалу, тасманийского дьявола, вомбата, утконоса., плодовая муха Квинсленда и сосна Воллеми.
«Мы очень гордимся историей вклада Университета Нового Южного Уэльса в геномику, и мы рады, что геном Сэнди теперь будет секвенирован в качестве приза за победу в этом конкурсе», - говорит молекулярный биолог Университета Нового Южного Уэльса и заместитель вице-канцлера (по образованию). Профессор Мерлин Кроссли.
"В Австралии так много интересных животных, которых нужно секвенировать, и результаты улучшают наше понимание эволюции и биологии и помогают улучшить сельское хозяйство и борьбу с вредителями."
Динго были завезены в Австралию около 5000 лет назад. Широко признано, что они не были одомашнены коренными австралийцами. Чистокровные динго становятся все более редкими, поскольку местные животные скрещиваются с дикими собаками и домашними собаками, а землевладельцы преследуют их как вредителей.
Смотрите видео с Сэнди: