Международный консорциум ученых предлагает масштабный проект по секвенированию, каталогизации и анализу геномов всех известных эукариотических видов на планете. петабайт цифровой памяти. К эукариотам относятся все организмы, кроме бактерий и архей. По оценкам, на Земле насчитывается 10-15 миллионов эукариотических видов.
Предлагаемая инициатива, описанная в статье, опубликованной в Proceedings of the National Academy of Sciences, потребует сотрудничества правительств, ученых, гражданских ученых и студентов со всего мира. Авторы предложения сравнивают его с Human Genome Project, международным научно-исследовательским проектом с 1990 по 2006 год, который стоил примерно 4,8 миллиарда долларов в сегодняшних долларах и обеспечил предполагаемый коэффициент возврата инвестиций 141: 1.
Проект «Геном человека» «задействовал более 47 000 человек, которые заработали почти 1 триллион долларов в экономической деятельности», - пишут авторы. Они называют свое новое предложение проектом Earth BioGenome Project..
«Впервые в истории можно эффективно секвенировать геномы всех известных видов и использовать геномику, чтобы помочь обнаружить оставшиеся 80-90 процентов видов, которые в настоящее время скрыты от науки», - пишут авторы. написал.
Похожая инициатива, Earth Microbiome Project, заручилась поддержкой более 500 ученых для секвенирования бактериальных и архейных геномов по всему миру.
Причин для осуществления такого амбициозного проекта много, сказал Джин Робинсон, руководитель предлагаемых усилий, профессор энтомологии и директор Института геномной биологии Карла Р. Вёзе в Университете Иллинойса.
«Геномика помогла ученым разработать новые лекарства и новые источники возобновляемой энергии, накормить растущее население, защитить окружающую среду и поддержать выживание и благополучие человечества», - сказал Робинсон. «Проект Earth BioGenome даст нам представление об истории и разнообразии жизни и поможет нам лучше понять, как ее сохранить».
Ученые до сих пор секвенировали менее 15 000 видов, большинство из которых являются микробами, сообщает команда. Однако стоимость секвенирования генома упала примерно до 1000 долларов за геном позвоночного среднего размера и, как ожидается, продолжит снижаться. Новые технологии, в том числе наземные и подводные роботы, а также увеличение инициатив граждан и ученых и консорциумов ученых, занимающихся конкретными группами организмов, ускоряют процесс сбора и анализа данных.
«Проект Earth BioGenome будет использовать существующие ресурсы и учреждения, чья миссия состоит в обеспечении и сохранении биоразнообразия в мире», - сказал Робинсон.«Например, коллекции ботанических садов мира содержат более трети всех видов растений».
Проект EBP будет поддерживать и продвигать международные протоколы для хранения и обмена данными. Координационный совет с членами из Африки, Австралии, Бразилии, Канады, Китая, Европейского Союза и США возглавит глобальную сеть сотрудников. В совет также войдут представители нескольких текущих крупномасштабных геномных проектов, включая Глобальную сеть биоразнообразия генома, Глобальный альянс по геномике беспозвоночных, Инициативу i5K по секвенированию 5 000 геномов членистоногих и проект «Геном 10 000»..
«Величайшим наследием EBP будет полная цифровая библиотека жизни, которая будет служить ориентиром для будущих открытий для поколений», - сказал Робинсон.
Робинсон вместе с профессором Харрисом А. Левином из Калифорнийского университета в Дэвисе является сопредседателем рабочей группы EBP; и У. Джон Кресс из Смитсоновского института.