Экологическая ДНК (eDNA), ядерная или митохондриальная ДНК, выделяемая организмом в окружающую среду, является быстро развивающимся инструментом для мониторинга распространения водных видов. В новом исследовании, опубликованном в Transactions of the American Fisheries Society, обсуждается способность eDNA точно предсказывать наличие, относительную численность и биомассу популяций дикой ручьевой форели (Salvelinus fontinalis)..
Исследование пришло к выводу, что эДНК является эффективным способом измерения водных популяций отдельных видов. эДНК правильно предсказала присутствие/отсутствие ручьевой форели в 85,0-92,5% из 40 водотоков, где были обследованы популяции рыб.
Ведущий автор исследования, Барри Балдиго, биолог-исследователь из Нью-Йоркского центра водных исследований Геологической службы США, сказал, что eDNA становится все более важным инструментом для быстрой и точной оценки биоразнообразия в водной среде обитания. Геологическая служба США, которая предоставляет объективную научную информацию для поддержки управления природными ресурсами Соединенных Штатов, работает над разработкой, улучшением и применением методов экологического мониторинга, таких как eDNA.
Популяции восточной ручьевой форели, местного вида рыбы, пользующегося большим спросом у рыболовов, были уничтожены кислотными дождями в ручьях и озерах гор Адирондак, где проводилось исследование. Считается, что этот вид восстанавливается в некоторых районах по мере снижения кислотности реки, но подтверждение восстановления на многочисленных участках в большом регионе с использованием типичных методов рыборазведки требует больших затрат времени и средств. Бальдиго и его коллеги смогли оценить численность речной форели в 40 ручьях, используя как электронную ДНК, так и стандартные исследования. Они показали, что эДНК правильно охарактеризовала популяции речной форели в 10 ручьях, где они отсутствовали, в 10 ручьях, где они были в изобилии, и еще в 20 ручьях, где они присутствовали с низкой или умеренной плотностью.
Улучшения в методах отбора проб и анализа эДНК за последнее десятилетие «увеличили нашу способность определять, присутствует ли вид или нет, и его относительную численность в водной среде обитания путем анализа одной пробы воды», - сказал Бальдиго. «Потенциал этого инструмента для характеристики популяций одного или нескольких видов в водной и наземной среде обитания кажется безграничным».