Исследовательская группа Университета Колорадо под руководством Денвера впервые разработала надежные генетические маркеры, известные как ядерные микросателлиты, для белокорой сосны. Это открытие может улучшить шансы дерева на выживание. Белокорая сосна, численность которой быстро сокращается почти по всему ареалу, в настоящее время рассматривается для включения в список в соответствии с Законом об исчезающих видах..
Согласно статье, опубликованной сегодня в PLOS ONE, новые генетические маркеры представляют собой полезный и недорогой метод скрининга белокорой сосны на уровни генетической изменчивости, предоставляя инструмент с множеством приложений для защиты быстро исчезающего дерева от вымирает. Предыдущие попытки найти эти маркеры для белокорой сосны не увенчались успехом из-за сложности и размера ее генома, который почти в девять раз превышает геном человека.
«Благодаря этому прорыву ученые могут начать скрининг белокорых сосен на предмет устойчивости к болезням, для стратегического сбора семян и других мер по сохранению и смягчению последствий изменения климата», - сказала доктор Диана Томбак, профессор кафедры интегративной биологии в CU Денвер.
"Генетический скрининг с использованием микросателлитов - это быстрый и доступный инструмент, который может помочь в исследованиях и усилиях по восстановлению этого особого дерева, которое играет важную экологическую роль в высокогорных экосистемах."
Эта высокогорная хвойная порода, находящаяся под угрозой исчезновения, произрастает на западе США и в Канаде и играет важную роль в защите водоразделов и в качестве пищи для диких животных, включая медведей гризли. Белокорой сосне угрожают неместные болезни, жуки горной сосны, сильные пожары, а также изменение климата.
Аспирант CU из Денвера Мариан Леа и Томбак возглавили исследовательскую группу, которой удалось разработать 23 микросателлитных маркера для белокорой сосны, в том числе 10 новых и 13 перенесенных из других пород сосны.
Члены исследовательской группы: д-р Джон Сайринг (профессор Линфилд-колледжа, штат Орегон) и д-р Ричард Кронн и Тара Дженнингс (Тихоокеанская северо-западная исследовательская станция Лесной службы США) инициировали эту работу, применив методы секвенирования генома к белой коре. генома сосны и выявления более 1000 областей генов-кандидатов для анализа. Доктор Лео Брюдерле и доктор Дженнифер Нил (Денверский ботанический сад) предоставили лабораторные методы, которые преобразовали эти области в простые генетические анализы. Леа, Сайринг и Дженнингс провели детальный скрининг новых и перенесенных маркеров, а Леа завершила популяционный анализ двух популяций белокрылки Йеллоустона, который предоставил доказательства того, что маркеры оказались успешными.