Искусственный интеллект может идентифицировать микроскопические морские организмы

Искусственный интеллект может идентифицировать микроскопические морские организмы
Искусственный интеллект может идентифицировать микроскопические морские организмы

Исследователи разработали программу искусственного интеллекта (ИИ), которая может автоматически обеспечивать идентификацию микроскопических морских организмов на уровне видов. Следующим шагом будет включение ИИ в роботизированную систему, которая поможет нам лучше понять Мировой океан как сейчас, так и в нашем доисторическом прошлом.

В частности, программа ИИ доказала свою способность идентифицировать шесть видов фораминифер или форамов - организмов, которые преобладали в океанах Земли более 100 миллионов лет.

Форамы - это протисты, ни растения, ни животные. Когда они умирают, они оставляют после себя крошечные панцири, в большинстве случаев менее миллиметра в ширину. Эти раковины дают ученым представление о характеристиках океанов в том виде, в каком они существовали, когда формации были живы. Например, разные виды форамов процветают в разной океанской среде, и химические измерения могут рассказать ученым обо всем, от химического состава океана до его температуры, когда формировалась раковина.

Однако оценка этих формовых раковин и окаменелостей утомительна и отнимает много времени. Вот почему междисциплинарная группа исследователей, обладающая опытом от робототехники до палеоокеанографии, работает над автоматизацией этого процесса.

«На данный момент ИИ правильно идентифицирует отверстия примерно в 80% случаев, что лучше, чем у большинства обученных людей», - говорит Эдгар Лобатон, доцент кафедры электротехники и вычислительной техники в Университете штата Северная Каролина и соавтор статьи о работе.

"Но это только доказательство концепции. Мы ожидаем, что система со временем улучшится, потому что машинное обучение означает, что программа будет становиться все более точной и последовательной с каждой итерацией. Мы также планируем расширить возможности ИИ, так что он может идентифицировать по крайней мере 35 видов отверстий, а не нынешние шесть."

Существующая система работает, помещая форму под микроскоп, способный делать фотографии. Светодиодное кольцо направляет свет на форму с 16 направлений - по одному за раз - при этом изображение формы создается при каждом изменении освещения. Эти 16 изображений объединены, чтобы предоставить как можно больше геометрической информации о форме отверстия. Затем ИИ использует эту информацию для идентификации видов форама.

Сканирование и идентификация занимает всего несколько секунд и уже так же быстро, или даже быстрее, чем самые быстрые люди-эксперты.

«Кроме того, ИИ не устает и не скучает», - говорит Лобатон. «Эта работа демонстрирует успешный первый шаг к созданию роботизированной платформы, которая сможет автоматически идентифицировать, выбирать и сортировать формы».

Лобатон и его сотрудники получили грант от Национального научного фонда (NSF), начиная с января 2019 года, на создание полнофункциональной роботизированной системы.

«Эта работа важна, потому что океаны покрывают около 70 процентов земной поверхности и играют огромную роль в ее климате», - говорит Том Маркитто, доцент геологических наук Колорадского университета в Боулдере и автор соответствующей статьи. бумаги.

Форамы распространены в наших океанах повсеместно, и химический состав их раковин фиксирует физические и химические характеристики вод, в которых они росли. Эти крошечные организмы свидетельствуют о прошлых свойствах, таких как температура, соленость, кислотность и концентрация питательных веществ. В свою очередь, мы можем использовать эти свойства для реконструкции циркуляции океана и переноса тепла во время прошлых климатических явлений.

«Это важно, потому что человечество находится в разгаре непреднамеренного климатического «эксперимента» глобального масштаба из-за нашего выброса парниковых газов», - говорит Маркитто.«Чтобы предсказать результаты этого эксперимента, нам нужно лучше понять, как климат Земли ведет себя при изменении ее энергетического баланса. Новый ИИ и роботизированная система, которую он позволит, могут значительно ускорить нашу способность узнать больше о взаимосвязи между климата и океанов в огромных временных масштабах».

В журнале Marine Micropaleontology опубликована статья «Автоматизированная идентификация планктонных фораминифер на уровне видов с использованием сверточных нейронных сетей в сравнении с человеческими способностями». Ведущим автором статьи является Ритаян Митра, бывший научный сотрудник с докторской степенью в штате Северная Каролина и Университете Колорадо в Боулдере, который сейчас работает в ИИТ Бомбея. Соавторы включают Q. Ge и B. Zhong, Ph. D. студенты штата Северная Каролина; Б. Канакия, бывший студент магистратуры штата Северная Каролина; РС. Кук из колледжа Уильямс; Дж. С. Ференбахер из Университета штата Орегон; Дж. Д. Ортис из Кентского государственного университета; и А. Трипати из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе.

Работа с ИИ была выполнена при поддержке NSF под номером гранта 1637039.