Кукуруза является основным кормом и биотопливной культурой, стоимость которой только в экономике Мичигана составляет около 3,7 миллиарда долларов. Однако знания о болезнетворных микроорганизмах всходов на кукурузных полях Мичигана ограничены. Группа ученых из Департамента растений, почв и микробиологии Мичиганского государственного университета поставила перед собой цель лучше понять состав патогенов, вызывающих рассаду, и получить результаты, которые помогут в исследованиях борьбы с болезнями не только кукурузы, но и севооборотных культур, таких как соя и пшеница.
Это исследование было сосредоточено на оомицетах, также известных как водяные плесени, которые включают в себя несколько сотен организмов, включая некоторые из наиболее разрушительных патогенов растений, некоторые из которых вызывают болезни рассады и корневую гниль. Они использовали как традиционные методы выделения патогенов, так и секвенирование ампликонов, чтобы идентифицировать наиболее распространенные оомицеты из проростков кукурузы и охарактеризовать изоляты по их способности вызывать заболевания на кукурузе.
«Исследование уникально, поскольку мы объединили традиционное выделение патогенов и секвенирование ампликонов для характеристики оомицетов кукурузы», - объяснил Мартин Чилверс, один из исследователей. «Использование обоих этих подходов позволило нам получить моментальный снимок оомицетов в почве и проростках кукурузы, а также позволило провести фенотипирование вирулентности и чувствительности к фунгицидам».
Это исследование приведет к лучшему пониманию причин болезней рассады и корневой гнили и позволит использовать более целенаправленные подходы к борьбе с болезнями, от выведения гибридов с улучшенной устойчивостью к корневой гнили до скрининга фунгицидов, которые борются с болезнями и улучшают управление.