До сих пор неизвестный устойчивый к антибиотикам вид бактерий, относящийся к тому же семейству, что и E. coli и Salmonella spp., был обнаружен и классифицирован в Швеции. Предлагаемое таксономическое название вида - первого из нового рода - Scandinavium goeteborgense, по названию города Гётеборг, Швеция, где была выделена бактерия и проведено исследование.
Знание того, какие бактерии вызывают инфекции и какие антибиотики эффективны и неэффективны против них, имеет решающее значение для выбора лечения. Незнание может иметь серьезные последствия, даже если инфекция обычно протекает без осложнений.
Как была обнаружена новая группа бактерий с ее новым генетическим вариантом устойчивости к антибиотикам, описано в исследовании, опубликованном в журнале Frontiers in Microbiology. Отправной точкой были бактерии, обнаруженные в инфицированной ране у взрослого пациента в больнице Кунгэльв к северу от Гётеборга.
Используя образец этого пациента, лаборатории клинической микробиологии Сальгренской университетской больницы в Гётеборге выделили бактерии, которые оказались принадлежащими к семейству Enterobacteriaceae. Однако идентификация видов требовала дальнейших, более всесторонних исследований и анализов.
Используя секвенирование следующего поколения (NGS) геномной ДНК, исследователи смогли охарактеризовать и классифицировать новые виды. Более того, оказалось, что он принадлежит к совершенно новому роду бактерий.
Упомянутые бактерии, скорее всего, вызывали инфекции до и после того, как они были обнаружены в больнице Кунгэльв, где образцы пациентов были взяты в 2014 году. Однако только сейчас был идентифицирован вид и его более конкретные черты стали известны.
Франсиско Сальва Серра, один из двух первых авторов исследования, проводит исследования в Коллекции культур Гетеборгского университета (CCUG) и в Центре исследований устойчивости к антибиотикам (CARe) Гетеборгского университета.
Это яркий пример того, как важно уметь определять непосредственные причины инфекции. Если бактерии идентифицированы точно, врачи могут назначать конкретные антибиотики, а не полагаться на антибиотики широкого спектра действия., - сказал Сальва Серра.
"Антибиотики широкого спектра действия способствуют развитию резистентности к антибиотикам у бактерий, в том числе вызывающих заболевания. В более широком смысле это приводит к снижению потенциала лечения инфекционных заболеваний."
Хедвиг Энгстрем Якобссон, старший научный сотрудник, ответственный за исследование, работает в отделении инфекционных заболеваний Сальгренской академии Гетеборгского университета и возглавляет отделение молекулярной микробиологии Сальгренской университетской больницы.
Она подчеркивает, что секвенирование следующего поколения произвело революцию в стратегиях ДНК-диагностики и наблюдения за бактериями.
«Это исследование потребовало проведения множества различных анализов, в которых технология дала нам как более обширные, так и более глубокие знания о новой бактерии и ее классификации, чем это было возможно раньше», - говорит Энгстрем Якобссон.
Название, предложенное учеными для вида бактерий Scandinavium goeteborgense, будет официально опубликовано в Международном журнале систематической и эволюционной микробиологии (IJSEM) в марте 2020 года.