Сделав шаг к преодолению разрыва между таксономией грибов и молекулярной экологией, ученые из нескольких учреждений, включая Лос-Аламосскую национальную лабораторию, охарактеризовали образец «загадочного» гриба, собранный в Северной Каролине и нашедший свой дом на грибковом дереве жизнь.
«Рабочие оценки говорят нам, что должно быть более 5 миллионов видов грибов», - сказала Шерил Куске, ученый из Лос-Аламоса, работающий над проектом. «На самом деле мы идентифицировали и полностью описали только 100 000 из них, и новые возможности секвенирования ДНК показывают нам, что многие образцы в исследовательских коллекциях не охарактеризованы. Решение этой конкретной загадки показывает потенциальную ценность использования секвенирования окружающей среды для направления таксономических и экологических открытий».
Образец грибка был интересен отчасти тем, что он представлял собой основной компонент наблюдаемой грибковой популяции в сосновом лесу и положительно реагировал на повышенный уровень CO2 и обработки азотом, имитирующие будущие условия окружающей среды - однако точное место образца в таксономическом порядке было неизвестно. Образец в конечном итоге получил новое название Bifiguratus adelaidae, как недавно сообщалось в журнале Mycologia.
Почему это было сложно? Во времена, когда простой щечный мазок, отправленный по почте вместе с чеком, может дать отчет о ДНК человека, в котором перечислены тысячи предков, идентификация образца кажется простой задачей. Но, как указывалось в редакционной статье журнала, этот образец представляет собой один из многих «грибов темной материи», населяющих неизвестные области грибкового древа жизни. Мы можем обнаружить их ДНК в образцах окружающей среды, но их культура неуловима.
Как отмечается в редакционной статье журнала: «Это размещение особенно интересно из-за более глубокого понимания роли микоризы (способности формировать симбиотические отношения, переносящие питательные вещества) для этой части филогенеза и того факта, что очень мало известно о видовом разнообразии и распространении в этой части дерева. Bifiguratus adelaidae может иметь симбиотическую функцию в корнях, что было обнаружено в корнях орхидей и каштанов, но это также хорошо задокументировано в почвах северных умеренных зон».
Интересно, что собранный образец был успешно культивирован в лаборатории только тогда, когда ему позволили расти в компании вида бактерий Methylobacterium, которые антибиотики не могли убить. Обычно образец грибка был бы очищен от таких загрязнений, но этот сопротивлялся их попыткам. Авторы утверждают, что присутствие симбиотических или комменсальных микробов может быть частью успеха культивирования. Куске отметил, что понимание сложных микробных и грибковых сообществ прогрессирует, позволяя организмам расти в виде определенных смесей.
Bifiguratus adelaidae был назван в честь Аделаиды Чаверри Полини. Доктор Чаверри была всемирно признанным тропическим биологом и образцом для подражания для женщин Латинской Америки в науке, технологиях, инженерии и математике. Ее основной вклад заключался в изучении и сохранении тропических горных лесов и безлесных альпийских лугов (парамос). Как биолог, она осознала важность микоризных грибов и внесла свой вклад в описание гриба семейства Acaulosporaceae, гриба того же типа, что и виды, описанные в этой статье. Она поддержала создание Службы национальных парков Коста-Рики, создав основу для обширного сохранения биологического разнообразия. В 2013 году она была включена в Galería de la Mujer, одну из самых высоких наград, присуждаемых женщинам Коста-Рики за их приверженность защите и улучшению прав человека женщин.