Ученые из Кентского университета разработали новый метод определения функции генов, что может иметь большое значение для нашего понимания процессов жизни.
Команда Школы биологических наук Университета разработала новый вычислительный подход, который позволил им присвоить функции генам, функции которых до сих пор были неизвестны.
Один из подходов к лучшему пониманию основных характеристик и требований жизни заключается в создании организмов с минимальным геномом, то есть с наименьшим количеством генов, обеспечивающих жизнь.
Доктор Марк Васс, профессор Мартин Михаэлис и Магдалена Антчак изучили организм с наименьшим геномом, созданным до сих пор, на основе бактерии (Mycoplasma mycoides), которая культивируется в среде, богатой питательными веществами. Он содержит 473 гена, почти треть (149) из которых имеют неизвестную функцию, что иллюстрирует ограниченность нашего нынешнего понимания того, как устроена жизнь.
Исследователи из Кента разработали новый вычислительный подход, который позволил им присвоить функции 66 генам с неизвестной функцией. Они обнаружили, что многие из закодированных функций играют роль в транспорте веществ в клетку и из нее.
Доктор Васс сказал: «Похоже, это отражает потребности организма с минимальным геномом в среде, богатой питательными веществами». Если питание доступно в изобилии, многие гены, выполняющие метаболические функции, не нужны, но транспортеры, которые обеспечивают транспорт питательных веществ в клетку и выведение (токсичных) метаболитов из клетки, становятся критически важными.
'Это указывает на то, что не существует одного минимального генома, но что природа минимального генома всегда будет формироваться окружающей средой. Следовательно, минимальный геном состоит из набора основных генов, необходимых для всех форм жизни, и второго набора генов-фасилитаторов, обеспечивающих жизнь в определенной среде».
Команда говорит, что их результаты должны проложить путь к более целенаправленным исследованиям по выявлению основных и вспомогательных наборов генов для углубления понимания фундаментальных процессов жизни.