Передовые компьютерные технологии и программное обеспечение превращают идентификацию видов в интерактивную: важная группа биологически управляемых ос из Центральной Европы используется для демонстраци

Передовые компьютерные технологии и программное обеспечение превращают идентификацию видов в интерактивную: важная группа биологически управляемых ос из Центральной Европы используется для демонстраци
Передовые компьютерные технологии и программное обеспечение превращают идентификацию видов в интерактивную: важная группа биологически управляемых ос из Центральной Европы используется для демонстраци

Представляя группу успешных агентов биологической борьбы с различными плодовыми мушками-вредителями, род паразитических ос остается в значительной степени упущенным из виду. Хотя его последний идентификационный ключ датируется 1969 годом, с тех пор было добавлено много новых видов. Что еще хуже, эта группа визуально идентичных видов, скорее всего, содержит много видов, которые еще предстоит описать как новые для науки.

Недавно изучив группу видов этих ос в Центральной Европе, ученые Фабиан Климмек и Ханнес Баур из Музея естественной истории Берна, Швейцария, не только продемонстрировали необходимость обновления знаний, но и продемонстрировали преимущества современной таксономическое программное обеспечение, способное анализировать большие объемы описательных и количественных данных.

Опубликованная в открытом доступе в журнале Biodiversity Data Journal таксономическая статья группы описывает новый вид - Pteromalus capito - и представляет обсуждение бесплатного Xper3, разработанного Лабораторией информатики и систематики Пьер- и-Университет Марии-Кюри. Программное обеспечение использовалось для создания общедоступного обновленного ключа для группы видов Pteromalus albipennis.

Полностью иллюстрированная интерактивная база данных охватывает 27 видов в группе и 18 родственных видов, в дополнение к полной диагностике, большому набору измерений тела и в общей сложности 585 изображений, отображающих большинство характерных признаков для каждого вида..

"В настоящее время передовые компьютерные технологии, процедуры измерения и оборудование позволяют использовать более изощренные способы включения количественных признаков, что значительно улучшает разграничение загадочных видов", - объясняют ученые.

"Недавно разработанное программное обеспечение для создания ключей биологической идентификации, такое как Xper3, Lucid или Delta, потенциально может заменить традиционные бумажные ключи."

Для понимания контекста авторы приводят пример с одним из исследованных видов ос, идентификация которого потребовала бы 16 шагов, если бы использовался ранее доступный идентификационный ключ, тогда как с интерактивной альтернативой потребовалось бы только 6 шагов..

Одна из причин, по которой такие инструменты, как Xper3, настолько быстры и эффективны, заключается в том, что автор ключа может перечислить все описательные символы в определенном порядке и присвоить им различный вес при разграничении видов. Таким образом, всякий раз, когда энтомолог пытается идентифицировать особь осы, программа сначала выполняет проверку по дескрипторам вверху, чтобы исключить несовпадающие таксоны и предоставить список оставшихся названий. Всякий раз, когда остается несколько имен, выполняется проверка дальше по списку, пока не останется одно, которое должно соответствовать образцу. В любой момент исследователь может получить доступ к хронологии, чтобы проверить возможные несоответствия, не прерывая процесс.

Являясь продуктом программного обеспечения, доступного в цифровом виде, интерактивные идентификационные ключи не только легко, быстро и недорого публикуются, но также легко редактируются и дополняются совместными усилиями. Эксперты со всего мира могут обновить ключ, если автор предоставит им определенные права пользователя. Однако независимо от того, сколько раз база данных обновлялась, постоянная URL-ссылка будет по-прежнему предоставлять доступ к последней версии в любое время.

Чтобы защитить свой ключ и лежащие в его основе данные в будущем, ученые разместили все файлы необработанных данных, R-скрипты, фотографии, списки файлов и подготовленные образцы в исследовательском центре данных Zenodo, созданном OpenAIRE и CERN.