Вирус Зика - это переносимое комарами инфекционное заболевание, связанное с определенными врожденными дефектами у младенцев в Южной и Центральной Америке и Соединенных Штатах. Исследователь из Национальной лаборатории Лоуренса Беркли (Berkeley Lab) Банумати Санкаран работал в составе межучрежденческой группы над картированием ключевого вирусного белка под названием NS5. Необходимый для размножения вируса, NS5 содержит два фермента: один снижает способность организма вырабатывать иммунный ответ против инфекции, а другой помогает запустить процесс генетической репликации. Работу возглавили Ченг Као из Университета Индианы и Пингвэй Ли из Техасского университета A&M (TAMU).
В исследовании, опубликованном 27 марта в Nature Communications, ученые описали структуру и функцию этих двух активных участков фермента. Они также сравнили этот белок с белками других родственных вирусов, вызывающих лихорадку денге, вирус Западного Нила, вирус японского энцефалита и гепатит С. Эти сравнения помогут исследователям в поиске возможных соединений, которые могут остановить способность вируса воспроизводиться..
Работая с исследователями из TAMU, Санкаран, научный сотрудник отдела молекулярной биофизики и интегрированного биоимиджинга в лаборатории Беркли, использовал рентгеновскую кристаллографию для определения атомной структуры NS5 в Центре структурной биологии Беркли в Продвинутом Источник света (АЛС). «ALS сыграл решающую роль в успехе этого проекта, - сказал Ли. "Мощный луч и чувствительный детектор на лучевой линии 5.0.2 позволил нам получить данные о наших кристаллах низкого качества."
Санкаран отвечает за программу совместной кристаллографии (CC) в ALS. Эта программа, финансируемая NIH, представляет собой быструю, надежную и прозрачную кристаллографическую службу по почте для сообщества структурной биологии. Поскольку комары, переносящие вектор, распространились на юг США, интерес к изучению вируса возрос, и Ли из TAMU указал, что несколько групп в настоящее время работают над аналогичными усилиями по определению структуры. «Наличие доступа к ультрасовременному оборудованию, предоставляемому нашей программой совместной кристаллографии, привело к быстрому завершению этого проекта», - говорит Санкаран.
Несмотря на то, что исследователи собрали много информации о том, как воздействовать на этот белок, загадки все еще остаются. «Один из наиболее важных нерешенных вопросов о вирусе Зика NS5 заключается в том, как он катализирует синтез РНК», - сказал Ли.«Мы с нетерпением ждем дальнейших исследований и будущего сотрудничества, которые будут иметь неоценимое значение для открытия терапевтических средств».