Поскольку Хэллоуин закончился, сегодня традиционно день, когда выходят рождественские украшения, поэтому вполне уместно, что культовое животное, связанное с праздником, поднимает праздничное настроение, присоединяясь к списку видов, чтобы иметь свой секвенирован геном. Сегодня в журнале открытого доступа GigaScience опубликована статья, описывающая секвенирование и анализ генома северного оленя. Эта работа, хотя и вряд ли раскрывает, почему северный олень Санты может летать, предоставляет отличный ресурс для более глубокого понимания процессов эволюции, одомашнивания, животноводства и адаптации к экстремальным условиям.
Северный олень (Rangifer tarandus) - единственный полностью одомашненный вид в семействе оленей, или Cervid. Это также единственный олень, распространенный по всему миру: в бореальных, тундровых, субарктических, арктических и горных регионах Северной Азии, Северной Америки и Европы. В отличие от всех других оленей, отрастают и сбрасывают рога не только самцы оленей, но и самки. С точки зрения животноводства оленье молоко намного богаче белком и содержит меньше лактозы, чем коровье молоко. Последний аспект делает доступность этого молока интересной, учитывая высокий процент людей с непереносимостью лактозы в мире. С таким разнообразием уникальных особенностей доступность последовательности генома северного оленя может предоставить целую кучу новой информации и является желанным новым членом элитного клуба домашних видов с эталонными геномами, включая корову, овцу и козу.
Первый автор статьи, Жепин Ли, доцент Института специальных наук о животных и растениях Китайской академии сельскохозяйственных наук, отметил, что анализ также выявил «335 генов, специфичных для северных оленей, которые, вероятно, помогут в понимание особых биологических особенностей северного оленя. Они также могут быть очень полезны для понимания эволюции северного оленя, а также всего семейства цервидных в будущих сравнительных исследованиях геномики северного оленя и других жвачных животных».
Для этой цели исследователи также построили эволюционное дерево, используя новый геном и уже доступные геномы членов семейства крупного рогатого скота. Они обнаружили, что северный олень, крупный рогатый скот и козы отделились от общего предка примерно 29,6 миллиона лет назад. Это было в эпоху олигоцена, когда одним из основных изменений стало глобальное расширение пастбищ.
Эта статья стала одним из победителей первого конкурса GigaScience и призового фонда, который используется для продвижения новых передовых исследований. Авторы представили свою работу на специальном заседании 12-й ежегодной Международной конференции BGI по геномике в Шэньчжэне в пятницу, 27 октября. В рамках открытого научного конкурса эта и другие статьи победителей рецензировались полностью открыто, где общественность могла следить за всем процессом публикации, начиная с открытого доступа к проекту статьи на сервере препринтов Biorxiv, процесса рецензирования. жить с рецензиями, доступными до принятия решения о публикации в системе рецензирования Academic Karma, за которыми следуют редакционные решения, исправления рукописи и публикация статьи со всей перепиской редактора, автора и рецензента, доступной вместе с опубликованной статьей.