Новые вирусы, вызывающие заболевания, часто исходят от животных. Хорошо известными примерами этого являются вирус Зика, передаваемый комарами, вирусы птичьего гриппа, а также вирус MERS, который связан с верблюдами. Чтобы быстро выявлять новые вирусные заболевания и предотвращать возможные эпидемии, ученые DZIF из Charité - Universitätsmedizin Berlin нацелились на поиск вирусов у животных. В текущем исследовании они обнаружили сотни новых вирусов у насекомых. Результаты опубликованы в журнале PLOS Pathogens..
«Каждый новый вирус, который мы находим, может быть причиной болезней, которые ранее были неизвестны, как у людей, так и у домашнего скота», - объясняет профессор. Доктор Кристиан Дростен, директор Института вирусологии в кампусе Шарите Митте. Ученый является специалистом по обнаружению и диагностике вирусов в Немецком центре исследований инфекций (DZIF). Например, его команда определила международный стандартный подход к диагностике MERS. В настоящее время он занимается диагностикой редких вирусов с использованием новых методов секвенирования. «Чем больше вирусов мы идентифицируем и добавляем в нашу базу данных, тем легче нам распознавать причину новых и необычных заболеваний», - говорит профессор Дростен.
В текущем исследовании исследовательская группа использовала крупнейшую международную базу данных транскриптомов насекомых, своего рода каталог активности генов, и изучила содержащиеся в ней данные в отношении геномов вирусов. Хотя ранее ученые концентрировались на комарах и других кровососущих насекомых, это исследование охватывает все группы насекомых. Систематически исследовались вирусы с геномами РНК с отрицательной цепью. В эту группу РНК-вирусов входят важные патогенные вирусы; они вызывают лихорадку Эбола и корь, а также бешенство и легочные инфекции.
В общей сложности у 1243 видов насекомых исследователи обнаружили вирусы, которые можно отнести как минимум к 20 новым родам. «Вероятно, это самая большая выборка животных, когда-либо проверенных на наличие новых вирусов», - говорит профессор Дростен. Рабочая группа уже добавила новые вирусы насекомых в свои поисковые базы данных. С помощью этих данных теперь можно будет расследовать случаи редких и необычных заболеваний у людей. Сюда входят пациенты, у которых проявляются все симптомы вирусной инфекции, однако в рассматриваемом случае вирус не может быть идентифицирован. «В таких случаях мы используем высокопроизводительные методы секвенирования для поиска всех вирусов, присутствующих у пациента», - объясняет вирусолог. «Если у пациента есть вирус, мы его найдем, если он есть в нашей базе данных или имеет сходство с вирусом в нашей базе данных». Шансы на успех поиска увеличатся благодаря добавлению новых вирусов насекомых.
В рамках проекта DZIF «Обнаружение вирусов и обеспечение готовности» ученые Charité продолжат фокусироваться на прогнозировании и обнаружении будущих вирусных угроз.