Исследователи из Центра интегративных медицинских наук RIKEN (IMS) в Японии и их коллеги из Университета Осаки обнаружили генетические вариации у людей, связанные с определенными привычками питания. Исследование ассоциации, опубликованное в журнале Nature Human Behavior, выявило 9 местоположений генов, связанных с употреблением таких продуктов, как мясо, тофу, сыр, чай и кофе. Среди них трое также были связаны с определенными заболеваниями, такими как рак или диабет.
Полногеномные ассоциативные исследования обычно проводятся, когда ученые хотят знать, связано ли заболевание с определенной генетической вариацией. Для этого они группируют сотни тысяч людей в зависимости от того, есть ли у них заболевание, и сравнивают геномы разных групп. Они сканируют весь геном в поисках вариаций ДНК, называемых однонуклеотидными полиморфизмами (SNP). Если они находят SNP, который постоянно связан с группой заболеваний, они могут сказать, что люди с этой генетической вариацией могут подвергаться риску заболевания.
Вместо того, чтобы сначала рассматривать болезни, команда RIKEN обратилась к диетическим привычкам. Они хотели выяснить, существуют ли какие-либо специфические генетические вариации, которые делают людей «рискующими» из-за того, что они привыкли есть определенные продукты. «Мы знаем, что то, что мы едим, определяет, кто мы есть, но мы обнаружили, что то, чем мы являемся, также определяет то, что мы едим», - говорит Юкинори Окада, старший приглашенный научный сотрудник RIKEN IMS и профессор Университета Осаки.
Используя генетические данные более 160 000 японцев, заполнивших анкету о частоте приема пищи, они обнаружили 9 генетических локусов - позиций на хромосомах - которые были связаны с потреблением кофе, чая, алкоголя, йогурта, сыра, натто (ферментированные соевые бобы), тофу, рыба, овощи или мясо. Первоначальные ассоциации диеты и генома показали, что ингредиенты имеют значение. Например, они обнаружили положительную генетическую корреляцию между употреблением сыра и употреблением йогурта.
В целом, исследование выявило 10 ассоциаций питания и генома, о которых раньше никогда не сообщалось; четыре связаны с кофе и три связаны с алкоголем. Было обнаружено, что один SNP, связанный с кофе и алкоголем, связан почти со всеми исследованными продуктами питания. «Мы обнаружили, что это конкретное изменение в одном нуклеотиде ДНК в гене ALDH2 было связано с потреблением меньшего количества алкоголя, натто, тофу и рыбы, и в то же время связано с потреблением большего количества кофе, зеленого чая, молока и йогурта. - говорит Окада.
Подобно тому, как геном включает в себя весь генетический материал организма, феном включает в себя все возможные наблюдаемые признаки, известные как фенотипы. Чтобы определить, связаны ли какие-либо SNP, связанные с диетой, с болезнями, исследователи провели общефеноменальное ассоциативное исследование. Результаты показали, что шесть SNP были связаны как минимум с одним фенотипом заболевания, включая несколько типов рака, а также диабет 2 типа.
Как и в случае полногеномных ассоциативных исследований болезней, текущие результаты могут принести пользу обществу в долгосрочной перспективе. Как объясняет Окада, «оценивая индивидуальные различия в пищевых привычках с учетом генетики, особенно «риск» злоупотребления алкоголем, мы можем помочь создать более здоровое общество».