Замечательные усилия исследователей Университета Квинсленда помогли увеличить количество известных геномов почти на 10 процентов.
Школа химии и молекулярной биологии UQ Будущий научный сотрудник ARC профессор Джин Тайсон сказал, что исследователи получили геномы 7280 бактерий и 623 архей (генетические материалы микроорганизмов) из образцов окружающей среды.
Это представляет собой почти 10-процентное увеличение по сравнению с 80 000 геномов, которые в настоящее время находятся в репозиториях геномов.
«Настоящая ценность этих геномов заключается в том, что многие из них эволюционно отличаются от ранее восстановленных геномов», - сказал профессор Тайсон, заместитель директора Австралийского центра экогеномики (ACE).
"Они увеличивают эволюционное разнообразие, охватываемое деревьями генома как бактерий, так и архей, более чем на 30 процентов, и являются первыми представителями 17 типов бактерий и трех типов архей."
Профессор Тайсон сказал, что большое микробное разнообразие еще предстоит открыть, при этом большинство микробов, наблюдаемых под микроскопом, не поддаются выращиванию в лабораторных условиях.
"Менее одного процента можно выращивать из-за сложных факторов, включая медленные темпы роста, привередливые требования к росту и необходимость перекрестного кормления другими видами", - сказал он..
Однако недавние достижения в области технологий секвенирования и вычислительных методов позволили восстанавливать геномы микробов непосредственно из образцов окружающей среды, минуя необходимость лабораторного культивирования.
«Приблизительно 8000 восстановленных геномов приближают нас к всеобъемлющему геномному представлению микробного мира, но также показывают, что многое еще предстоит открыть», - сказал он.
Соавтор ACE доктор Донован Паркс впервые заявил, что наука располагает необходимыми инструментами для существенного проникновения в огромное разнообразие филогенетической и метаболической жизни.
«Мы ожидаем, что обработка образцов окружающей среды, хранящихся в других общедоступных хранилищах, добавит к древу жизни десятки тысяч дополнительных микробных геномов», - сказал он.
Во время завершения этого исследования было сообщено о многочисленных исследованиях, в которых использовались десятки или сотни эволюционно разнообразных геномов из различных сред.
"Инструменты для получения геномов из образцов окружающей среды постоянно совершенствуются, и мы ожидаем, что повторная обработка образцов, рассмотренных в этом исследовании, приведет к восстановлению дополнительных геномов."
"Создание всеобъемлющего геномного хранилища микробного разнообразия закладывает основу для дальнейшего понимания роли микроорганизмов в важнейших биогеохимических и промышленных процессах."