Принято считать, что анатомически современные люди скрещивались со своими близкими родственниками, неандертальцами и денисовцами, когда они рассеялись из Африки. Но исследование фрагментов ДНК, переданных от этих древних гоминидов современным людям, живущим на островах Юго-Восточной Азии и Новой Гвинее, теперь позволяет предположить, что предки папуасов включают не одну, а две отдельные денисовские линии, которые были отделены друг от друга на протяжении сотен тысячелетий. тысячи лет. На самом деле, предполагают исследователи, одна из этих денисовских линий настолько отличается от другой, что их действительно следует рассматривать как совершенно новый архаичный вид гоминидов.
Выводы, основанные на новой коллекции данных о геноме, сделанной соавторами исследования из Института молекулярной биологии Эйкмана в Джакарте, Индонезия, опубликованы 11 апреля в журнале Cell. В совокупности с предыдущей работой, указывающей на третью денисовскую линию в геномах современных сибиряков, коренных американцев и выходцев из Восточной Азии, данные «предполагают, что современные люди скрещивались с многочисленными денисовскими популяциями, которые были географически изолированы друг от друга на глубине эволюционное время», - пишут исследователи.
Новые данные показывают, что современные люди, впервые выбравшись из Африки, вступали в новый мир, который выглядел совершенно иначе, чем тот, который мы видим сегодня. «Раньше мы думали, что это были только мы - современные люди - и неандертальцы», - говорит старший автор Мюррей Кокс из Университета Мэсси в Новой Зеландии. «Теперь мы знаем, что по всей планете существовало огромное разнообразие человекоподобных групп. Наши предки постоянно контактировали с ними."
Новые данные также неожиданно показывают дополнительное смешение между папуасами и одной из двух денисовских групп, предполагая, что эта группа действительно жила в Новой Гвинее или на прилегающих к ней островах. «Раньше считалось, что денисовцы жили на материковой части Азии и далеко на севере, - говорит Кокс. «Наша работа вместо этого показывает, что центр архаичного разнообразия находился не в Европе или на замерзшем севере, а в тропической Азии».
Уже было ясно, что острова Юго-Восточной Азии и Новой Гвинеи были особым местом, где люди несли больше архаичных ДНК гоминидов, чем где-либо еще на Земле. Этот регион также был признан ключевым для ранней эволюции Homo sapiens за пределами Африки. Но в истории были пробелы.
Чтобы заполнить эти пробелы, команда Кокса извлекла архаичные гаплотипы из 161 нового генома, охватывающего 14 групп островов в Юго-Восточной Азии и Новой Гвинее. Их анализы обнаружили большие участки ДНК, которые не соответствовали ни одной интрогрессии генов от денисовцев к людям в этом регионе. Вместо этого, сообщают они, современные папуасы несут сотни вариантов генов из двух глубоко расходящихся денисовских линий. Фактически, по их оценкам, эти две группы денисовцев были отделены друг от друга на протяжении 350 000 лет.
Новые результаты показывают, насколько «невероятно малоизученной» была эта часть мира, говорят исследователи. Для сравнения: многие участники исследования живут в Индонезии, стране размером с Европу, которая является 4-й по величине страной по численности населения. И все же, помимо пары геномов, о которых сообщалось в глобальном обзоре геномного разнообразия в 2016 году, в новой статье сообщается о первых последовательностях индонезийского генома. В исследованиях архаичных гоминидов также наблюдается сильный уклон в сторону Европы и северной Евразии, потому что ДНК, собранная из древних костей, лучше всего сохраняется на холодном севере.
Это отсутствие глобального представления как в древних, так и в современных данных о геноме хорошо известно, говорят исследователи. «Однако мы не думаем, что люди на самом деле осознали, насколько предвзятым это является для научных интерпретаций - таких, как, например, географическое распределение архаичных популяций гоминидов», - говорит Кокс.
Как бы увлекательны ни были эти новые открытия, исследователи говорят, что их основная цель - использовать эти новые геномные данные для улучшения здравоохранения для людей на островах Юго-Восточной Азии. Они говорят, что это первое исследование генома в регионе теперь предлагает базовую информацию, необходимую для начала этой работы.
Это исследование было поддержано Национальным научным фондом, грантом уровня II Министерства образования Сингапура, президентской постдокторской стипендией NTU, индивидуальной стипендией Института сложности NTU, французским грантом ANR, грантом Европейского Союза через Европейский региональный Фонд развития, грант Марсдена Королевского общества Новой Зеландии и стипендию Немецкого фонда Александра фон Гумбольдта. Вычислительные ресурсы были предоставлены в рамках исследовательского гранта Microsoft для облачных вычислений Azure и Центра высокопроизводительных вычислений Тартуского университета, Эстония.