Гигантские вирусы в море: геном вируса Bodo s altans состоит из 1,39 миллиона оснований ДНК

Гигантские вирусы в море: геном вируса Bodo s altans состоит из 1,39 миллиона оснований ДНК
Гигантские вирусы в море: геном вируса Bodo s altans состоит из 1,39 миллиона оснований ДНК

Вирус Bodo s altans, первый изолированный представитель самых распространенных гигантских вирусов в море, был обнаружен исследователями из Университета Британской Колумбии.

Вирус, чей геном весит 1,39 миллиона оснований ДНК, является одним из крупнейших гигантских вирусов, когда-либо выделенных, и самым крупным из известных, заражающих зоопланктон.

«Вирус Bodo s altans - один из немногих охарактеризованных нами гигантов, который заражает обычного и экологически важного хозяина», - говорит исследователь из Университета Британской Колумбии Кертис Саттл.«Это представитель самых распространенных гигантских вирусов в море, но до тех пор, пока не был обнаружен BsV, не было возможности исследовать эти вирусы в лаборатории».

Поскольку вирус Bodo s altans (BsV) должен конкурировать с множеством других вирусов, чтобы заразить своего многочисленного хозяина - микрозоопланктон под названием Bodo s altans, - он вооружен до зубов. Он обладает арсеналом токсинов и ферментов, разрезающих ДНК, которые, вероятно, мешают другим вирусам, пытающимся размножаться внутри хозяина.

Во время инфекции BsV маневрирует в направлении задней части клетки-хозяина и высвобождает свой вирусный геном. Похоже, что по мере эволюции BsV украл генетические механизмы у хозяина, чтобы помочь в процессе заражения.

BsV не несет транспортную РНК (тРНК), часть механизма репликации, которую несут все другие гигантские вирусы. Однако он несет гены репарации тРНК, что делает вероятным использование вирусом собственной тРНК хозяина во время заражения. Опять же, эти гены, по-видимому, были заимствованы вирусом непосредственно у хозяина.

Более 10 процентов генома BsV кодирует одну и ту же группу белков, которые, вероятно, участвуют в борьбе с противовирусной системой хозяина.

«Эти гены активно дублируются в аккордеонном механизме на периферии вирусного генома», - говорит аспирант UBC Кристоф Диг, первый автор статьи. «Это говорит о том, что вирус участвует в эволюционной гонке вооружений со своим хозяином, и может предложить объяснение того, как геномы гигантских вирусов могут достичь своей впечатляющей сложности».

Гигантские вирусы имеют гораздо больше ДНК, чем обычные вирусы, что позволяет им производить множество белков, позволяющих им размножаться в значительной степени независимо от их хозяина.

Хотя исследователи знали о существовании BsV-подобных вирусов на основании секвенирования ДНК из окружающей среды, только сейчас был обнаружен и изучен в лаборатории репрезентативный вирус. Вирус Bodo s altans был выделен в образцах из Мемориального сада Нитобе Университета Британской Колумбии.