Используя широкий спектр анализа эДНК в сочетании с традиционными методами исследования коллекций, японские исследователи определили место размножения находящихся под угрозой исчезновения видов рыб Acheilognathus typus в русле реки Омоно в префектуре Акита, Япония. Результаты были опубликованы 14 ноября в онлайн-издании The Science of Nature - Naturwissenschaften..
Съемка водных организмов - длительный и трудоемкий процесс, а охват обширной территории требует больших затрат. Анализ ДНК окружающей среды (eDNA) обеспечивает решение этих проблем. В подводных средах, таких как озера, водохранилища и реки, мы можем найти фрагменты ДНК, дрейфующие в воде из фекалий, кожи или любого другого источника обитающих в воде организмов. Анализ эДНК особенно эффективен для редких видов, таких как A. typus, который трудно найти с помощью традиционных методов исследования из-за низкой плотности его популяции. В этом исследовании исследовательская группа провела широкомасштабное исследование эДНК, за которым последовало традиционное исследование коллекции, чтобы найти новую среду обитания A. typus в реке Омоно, префектура Акита, Япония.
В течение трех дней в августе 2016 года команда собирала образцы поверхностных вод в 99 точках, охватывающих 112 км реки Омоно, и извлекала из образцов эДНК. Они измерили ДНК, используя специальную систему обнаружения A. typus. После этого они разместили стационарные сети и бутылочные ловушки в местах, где была обнаружена эДНК, и подтвердили присутствие взрослых рыб. Команда также использовала двустворчатых моллюсков (где A. typus откладывает яйца), чтобы подтвердить, что они размножаются.
В 99 обследованных участках реки Омоно эДНК A. typus была обнаружена в 2 местах, и в одном из этих мест группа захватила один экземпляр самца и одну самку. Яйца двустворчатого моллюска были обнаружены в том же месте, поэтому им удалось идентифицировать его как место размножения A. typus.
Эти результаты показывают, что с точки зрения стоимости и надежности сочетание анализа эДНК и традиционных методов сбора очень эффективно для определения местообитаний и районов размножения редких видов. Эти методы дополняют друг друга: метод эДНК подходит для обследования обширных территорий, а сбор образцов очень надежен для подтверждения видов. Эта комбинация методов может помочь сохранить этот вид, найдя больше мест размножения и создав заповедники. Его также можно использовать для других редких и находящихся под угрозой исчезновения видов с низкой плотностью популяции, разбросанной по обширной территории.