Понимание генов и белков, участвующих в хищническом поведении видов паразитических дрожжей, может привести к новым стратегиям борьбы с дрожжевыми патогенами, согласно исследованию, опубликованному 9 мая в журнале открытого доступа PLOS Pathogens Юргеном Вендландом из Исследовательская лаборатория Carlsberg в Дании и Брюссельский свободный университет в Бельгии, а также их коллеги.
Патогенные дрожжи и грибки представляют собой растущую проблему здравоохранения во всем мире, но открытие новых противогрибковых средств идет медленно. Недавно было продемонстрировано, что паразитические дрожжи Saccharomycopsis schoenii способны убивать появляющийся дрожжевой патоген Candida auris с множественной лекарственной устойчивостью. Однако молекулярные механизмы, участвующие в хищнической деятельности S. schoenii, не изучены. С этой целью исследователи секвенировали, собрали и аннотировали проект генома S. schoenii. Они объединили количественные анализы микроскопии живых клеток с геномными, транскриптомными и протеомными подходами для идентификации генов и белков, которые сверхэкспрессируются S. schoenii во время хищничества модельной клетки-жертвы Saccharomyces cerevisiae.
Исследователи предположили, что потребность в органических соединениях серы, особенно в метионине, играет центральную роль в хищническом поведении S. schoenii. Удивительно, но они обнаружили, что общее ограничение питания, а не конкретный дефицит метионина, вызывает хищную активность. Во время хищничества как протеомный, так и транскриптомный анализы показали, что S. schoenii сильно активировала и транслировала гены, которые кодируют ферменты, называемые аспарагиновыми протеазами, которые, вероятно, используются для разрушения клеточных стенок жертвы. По мнению авторов, эти фундаментальные сведения о хищническом поведении S.schoenii открывают новые возможности для использования этих дрожжей в качестве средства биологической борьбы или источника новых противогрибковых средств.
Авторы добавляют: «Благодаря совместным усилиям инструментов глобального анализа больших данных мы смогли поместить Saccharomycopsis schoenii в кладу CTG и проанализировать хищническое поведение этих дрожжей, чтобы идентифицировать гены и пути, которые, вероятно, играют решающую роль. в процессе хищничества. Кроме того, с помощью покадровой микроскопии in vivo, «пойманной в действии», мы смогли отслеживать хищническое поведение и гибель клеток-жертв с течением времени».