Шэрон Браунинг из Вашингтонского университета и его коллеги разработали метод оценки исторической эффективной численности населения, то есть количества людей, которые передают свои гены следующему поколению, чтобы выявить меняющуюся демографическую историю населения США в течение последние несколько тысяч лет. Они сообщают о своих выводах в новом исследовании, опубликованном 24 мая 2018 года в PLOS Genetics.
Многие популяции в США смешанные, с предками из Европы, Африки и Америки. Изучая полногеномные данные от нескольких сотен особей из популяции, ученые могут узнать не только текущую эффективную численность популяции, но и размеры предковых популяций, которые когда-то вносили свои гены. В текущем исследовании исследователи разработали метод оценки фактического размера населения в прошлом и использовали его для анализа данных девяти групп населения, включенных в исследование здоровья латиноамериканцев, а также афро-американского и европейско-американского населения в Питтсбурге и Мемфисе. По их оценкам, общая эффективная численность населения существенно сократилась после начала иммиграции из Европы и Африки, достигнув минимума около 12 поколений назад, но несколько поколений спустя восстановилась. Исследователи изучили это сокращение численности населения, также известное как узкие места, и обнаружили, что самое маленькое узкое место возникло в Пуэрто-Рико, где эффективная численность в какой-то момент упала всего до одной тысячи человек.
Разницы в исторических эффективных размерах между этими популяциями могут быть полезны для понимания того, почему отдельные группы сталкиваются с разными рисками для здоровья и болезней. Они также могут быть полезны ученым при отборе популяций, которые будут наиболее полезны для исследований, выявляющих гены, связанные с конкретными заболеваниями.
Шарон Браунинг добавляет: «Смешанные популяции в Америке подобны веревкам, сплетенным из нескольких разных волокон, причем волокна представляют разные группы предков. Генетический состав этих разных групп в целом очень похож, но отличается. достаточно, чтобы мы могли отличить генетический материал от каждой группы предков и изучить его свойства, что говорит нам об истории этих популяций.
Мы обнаружили, что около 100 поколений назад, то есть примерно несколько тысяч лет назад, эффективные размеры предков европейцев, африканцев и коренных американцев, вносящие свой вклад в нынешнее население Америки, составляли около нескольких десятков тысяч особей каждое.. Мы также обнаружили четкие признаки последствий миграции и колонизации с сокращением эффективной численности населения около 12 поколений назад, то есть примерно 300 лет назад».