Группа исследователей из учреждений, занимающих передовые позиции в новой области палеопротеомики, опубликовала руководство, чтобы заложить прочную основу. Древние белки используются для изучения всего: от вымерших видов до питания древних людей, эволюции болезней и многого другого. Руководство, опубликованное в журнале Nature Ecology & Evolution, направлено на поддержку передового опыта в этой области и обеспечение получения надежных воспроизводимых результатов.
Область палеопротеомики - анализ древних белков - в последние годы оказалась в центре внимания. Сохраняясь в десять раз дольше, чем ДНК, древние белки позволяют ученым заглянуть в далекое прошлое. Новые технологии сделали эту работу все более мощной, а ее результаты - более подробными. Теперь ученые могут использовать следовые количества археологических белков для реконструкции взаимоотношений вымершей мегафауны, отслеживания распространения молочного животноводства в доисторические времена и характеристики иммунных реакций у людей, умерших тысячи лет назад. Это позволило исследователям лучше ответить на ряд вопросов, от эволюции вымерших видов до реконструкции рациона человека в прошлом и лучшего понимания хронических заболеваний.
Набор рекомендаций по обеспечению согласованности в новом поле
Как молодая дисциплина, палеопротеомика сталкивается со многими из тех же препятствий, которые когда-то бросали вызов области древней ДНК, а именно с отсутствием последовательности в стандартах представления данных, мерах аутентификации и процедурах, принятых для предотвращения загрязнения. Без строгих стандартов лабораторные загрязнения и артефакты данных могут быть легко неверно истолкованы, что приведет к ложным утверждениям. В этой публикации авторы изложили ряд «передовых практик» для отбора проб, генерации, анализа и представления данных о последовательностях древних белков в научной литературе, чтобы поддержать исследователей, рецензентов и редакторов. Команда примечательна тем, что в ее состав входят международные исследователи из многих ведущих университетов и институтов, работающих в этой новой области, в том числе Институт истории человечества Макса Планка, Институт эволюционной антропологии Макса Планка, Копенгагенский университет, Университет Йорка, Туринского университета, Университета Оклахомы и Цюрихского университета/ETH Zürich.
Авторы подчеркивают, что они не намерены создавать жесткие, непреложные правила или отменять существующие стандарты, а скорее объединять и укреплять передовой опыт в этой области. «Несомненно, по мере появления новых лабораторных и статистических стратегий для характеристики белков эти рекомендации потребуют обсуждения в сообществе и дальнейшего обновления», - заявляет соавтор Фридо Велкер из Института эволюционной антропологии Макса Планка. «Однако мы надеемся, что представленные здесь стандарты практики помогут заложить прочную основу для палеопротеомики как метода для использования в различных областях».
Использование потенциала новых методов
В частности, исследователи подчеркивают, что публикации должны как минимум содержать адекватную информацию о том, как данные были сгенерированы и проверены, чтобы другие могли эффективно оценить результаты. «Палеопротеомика обладает огромным потенциалом для значительного расширения археологических, палеонтологических и эволюционных исследований», - объясняет соавтор Джессика Хенди из Института истории человечества им. Макса Планка.«Очень важно, чтобы дисциплина придерживалась высоких стандартов, чтобы гарантировать, что она способна реализовать этот потенциал».