Исследовательская группа из Университета Тохоку сделала важное открытие, имеющее позитивные последствия для разработки препаратов для борьбы с бактериями. Сайт аминоацил-тРНК (A-сайт) области декодирования 16S РНК в бактериальной рибосоме выглядит многообещающе для новой эры разработки антибиотиков.
Традиционные аминогликозидные антибиотики проблематичны, учитывая их высокую токсичность и возможность развития резистентности. Исследования в Университете Тохоку были сосредоточены на бактериальных А-сайтах, связывающих небольшие лиганды, структуры которых отличаются от семейства аминогликозидов, что открывает потенциал для разработки новых лекарств для лечения бактериальных инфекций с уменьшением проблем, связанных с традиционными антибиотиками.
Исследовательская группа под руководством доктора Сейити Нисидзавы и доктора Юсуке Сато (кафедра химии, Высшая школа естественных наук) сообщила о новом маленьком лиганде, ATMND-C2-NH2, который обладает самым сильным сродством к связыванию с бактериями. A-сайт среди неаминогликозидных лигандов.
ATMND-C2-NH2 демонстрирует значительную реакцию тушения флуоресценции при селективном связывании с внутренней петлей бактериальной (Escherichia coli) А-сайт-содержащей модельной РНК. ATMND-C2-NH2 также оказался полезным в качестве индикатора для оценки взаимодействия лиганд/A-участок.
Результаты, полученные исследовательской группой, предлагают рациональную основу для создания новых лигандов, связывающихся с A-сайтом, с целью создания новых антибиотиков с меньшей токсичностью и минимальным развитием резистентности.