Экологическая ДНК в образцах морской воды может предоставить точную информацию о популяциях глубоководных рыб, согласно исследованию, опубликованному 16 ноября 2016 года в журнале открытого доступа PLOS ONE Филипом Фрэнсисом Томсеном из Центра геогенетики Датского центра естественной истории. Музей Копенгагенского университета, Дания, и коллеги.
Рыба в отдаленных полярных и глубоководных местообитаниях находится под угрозой из-за изменения климата и увеличения промысловых усилий, что делает важным мониторинг популяций. Однако мониторинг может быть затруднен с технической точки зрения и в настоящее время зависит от инвазивных методов, таких как донное траление и ненадежные отчеты об уловах. Поэтому необходимы менее инвазивные и более надежные методы мониторинга.
Чтобы удовлетворить эту потребность, Томсен и его коллеги оценили альтернативный метод мониторинга, основанный на секвенировании ДНК окружающей среды (eDNA) в образцах морской воды. Они собрали образцы морской воды на участках у юго-запада Гренландии на разной глубине от 188 до 918 метров, секвенировали ДНК в этих образцах, чтобы определить присутствующие виды рыб. Они сравнили эти результаты с данными об уловах, полученными при одновременном тралении на каждом участке.
Томсен и его коллеги обнаружили, что данные о биомассе и численности рыб коррелируют с численностью последовательностей эДНК. Двадцать шесть семейств рыб, включая скатов и палтусов, были идентифицированы как методом тралового лова, так и методом ДНК из окружающей среды, по сравнению с двумя семействами, обнаруженными только при траловом промысле, и тремя только с помощью эДНК. Образцы ДНК в окружающей среде также выявили более высокую численность гренландской акулы, чем при тралении, что может указывать на то, что этот метод может эффективно обнаруживать крупную рыбу, которая может уклоняться от траловых сетей.
Отбор образцов ДНК из окружающей среды должен пройти дальнейшее тестирование, чтобы определить его эффективность в качестве метода мониторинга. Тем не менее, авторы заявляют, что их исследование демонстрирует, как эДНК можно использовать для неинвазивного мониторинга, коммерческого рыболовства, а также для оценки воздействия изменения климата на биоразнообразие этих отдаленных экосистем.