Исследователи LSTM использовали биоинформатический подход для интеграции информации из многочисленных исследований устойчивости комаров к инсектицидам и обнаружили ряд важных механизмов устойчивости, которые ранее не были известны.
В исследовании, опубликованном в журнале Nature Communications, доктор Виктория Ингам и ее коллеги использовали специализированное компьютерное программирование, чтобы лучше понять механизмы, с помощью которых комары становятся устойчивыми к современным инсектицидам общественного здравоохранения. Она сказала: «Для борьбы с малярией и другими трансмиссивными заболеваниями очень важно, чтобы мы могли полностью понять, как возникает устойчивость к инсектицидам в популяциях комаров. В прошлом была проведена обширная работа над конкретными семействами генов, которые считаются быть ключом к устойчивости, однако, используя метод интеграции данных, мы показали, что существует ряд дополнительных механизмов, которые, по нашему мнению, важны для очистки от инсектицидов».
Устойчивость к инсектицидам представляет собой серьезную угрозу для общественного здравоохранения во всем мире, снижая эффективность усилий по борьбе с переносчиками инфекции, которые в настоящее время в значительной степени зависят от инсектицидов для использования на надкроватных сетках, а также для остаточного опрыскивания помещений или распыления с воздуха. Резистентность широко распространена у основных переносчиков болезней, включая переносчика, ответственного за передачу малярийного паразита, комара Anopheles.
Понимание причин этой устойчивости имеет решающее значение для разработки стратегий борьбы с устойчивостью и для разработки новых инсектицидов. В текущем исследовании сравнивались модели экспрессии генов из 31 набора данных, собранных из устойчивых и восприимчивых популяций Anopheles в странах Африки к югу от Сахары за пятилетний период, чтобы выявить закономерности и дать представление о механизмах устойчивости к инсектицидам
LSTM Профессор Хилари Рэнсон является старшим автором статьи. Она сказала: «Большинство крупномасштабных сокращений смертности от малярии за последние несколько десятилетий являются результатом использования инсектицидов. Повышение устойчивости к инсектицидам представляет собой реальную угрозу для этих основных инструментов. В этом документе показано, что комары разработали несколько подходов. для защиты от инсектицидов; эти знания являются ключом к разработке стратегий борьбы с устойчивостью"
Данные, используемые в статье, были объединены и доступны в новом веб-приложении, размещенном в LSTM. Приложение IR-TEx (Insecticide Resistance Transcript Explorer) находится в свободном доступе и может использоваться другими исследователями и политиками, чтобы лучше информировать их о механизмах устойчивости, действующих в разных местах Африки к югу от Сахары. Приложение, разработанное доктором Ингамом, представляет данные в более доступном формате, который проще использовать тем, кто не разбирается в программировании. Она сказала: «Мы всегда были настроены на то, чтобы работа была полностью открыта для других, чтобы они могли использовать ее для решения своих собственных исследовательских вопросов. Она полностью доступна для поиска по видам комаров, странам и классам инсектицидов, и ее можно загрузить. Она удобна для пользователя и доступна для тех, кто в полевые ситуации."