Исследователи в Японии успешно расшифровали весь геном японской ипомеи. Японская ипомея (Ipomoea nil) - традиционные садовые растения, популярные в Японии. Летом этот цветок можно увидеть во многих японских садах. Кроме того, известно, что мутанты часто появляются у ипомеи из-за действия «прыгающих генов», называемых транспозонами. С периода Эдо (около 200 лет назад) выращивали и ценили ипомеи с цветами и листьями странной формы, и это превратилось в уникальную культуру садоводства в Японии. Из-за популярности этих «ипомеи-мутантов» было собрано много естественных мутантов. В наше время, детально проанализировав эти мутанты, исследователи обнаружили ряд генов, определяющих форму цветов и листьев, а также их окраску и рисунок.
Исследовательская группа расшифровала полный геном стандартной линии японской ипомеи. Один из руководителей исследования, профессор Ясубуми Сакакибара из Университета Кейо, который отвечал за сборку и биоинформатический анализ генома в настоящем исследовании, сказал, что «была получена высококачественная почти полная последовательность генома, что привело к идентификации кодирующих последовательностей. примерно из сорока трех тысяч генов ипомеи, а также количества и распределения транспозонов, которые производят ошеломляющее разнообразие цветов и форм ипомеи».
Исследовательская группа использовала всю последовательность генома, чтобы охарактеризовать мутантов, демонстрирующих карликовость с темно-зелеными, толстыми и морщинистыми листьями. Они идентифицировали ген биосинтеза растительных гормонов, который нарушен транспозонами у мутантов.
Лектор Университета Кюсю Эйдзи Нитасака, управляющий запасами Национального биоресурсного проекта (NBRP) Morning Glory, сказал: «С расшифровкой генома ценность использования японской ипомеи в качестве модельного организма резко возросла. Я надеюсь, что японцы ипомеи и их мутанты будут использоваться многими исследователями по всему миру». Один из руководителей этого исследования, доцент Ацуси Хосино из Национального института фундаментальной биологии, сказал: «Последовательность генома японской ипомеи не только поможет понять природу самой ипомеи, но и будет использоваться в исследованиях». близкородственных культур, таких как сладкий картофель». Исследование было опубликовано в Nature Communications..