Почва под нашими ногами не так биологически разнообразна, как считали ученые ранее, по данным исследовательской группы, в которую входит эколог почвенных микробов Технологического института Вирджинии.
Остатки ДНК от мертвых организмов, известные как «реликтовая ДНК», исторически мешали оценкам, заставляя ученых переоценивать микробное разнообразие на целых 55 процентов. Понимание микробного разнообразия в почве имеет решающее значение для понимания того, как происходят экологические процессы, такие как фиксация атмосферного азота и изменение климата.
Но команда, в которую входит Майкл Стрикленд, доцент кафедры биологических наук Колледжа естественных наук, использовала технику высокопроизводительного секвенирования, чтобы определить точный состав 31 образца почвы из различных климатических условий и экосистем.
Результаты были опубликованы в Nature Microbiology на этой неделе.
«Когда мы начали понимать, что наши цифры могут быть ошибочными, мы знали, что должны найти способ более внимательно изучить, сколько видов существует на самом деле», - сказал Стрикленд, который также связан с университетским университетом. Центр глобальных изменений и Институт наук о жизни Фралина.
Информация о популяциях микробов в почве важна, поскольку эти организмы играют решающую роль в наземной экосистеме и помогают поддерживать плодородие почвы.
Но связать деятельность микробов с почвенными процессами сложно. Ученым необходимо измерять живые микробы - сложная задача, потому что ДНК мертвых микробов может годами сохраняться в почве, затрудняя анализ микробного разнообразия.
«Это исследование показывает, что значительная часть микроорганизмов, обнаруженных в почве с помощью методов на основе ДНК, больше не живы», - сказал Эмбер Моррисси, доцент кафедры наук о растениях и почве в Университете Западной Вирджинии, который не участвовал в исследовании. исследовательский проект. «Как следствие, нам может понадобиться использовать инструменты, которые отличают генетический материал живых клеток от реликтовой ДНК мертвых микробов, чтобы понять влияние микробных «видов» на важные экосистемные процессы».
Пол Карини, микробный экофизиолог из Университета Колорадо в Боулдере и первый автор статьи, использовал PMA, фотореактивный краситель, который связывается с реликтовой ДНК, но плохо прилипает к живым клеткам, чтобы отличить жизнеспособные клетки от ДНК. мусор в почве.
«Учет реликтовой ДНК в наших анализах поможет нам понять важные приливы и отливы почвенного микробиома и поможет нам лучше понять, как микробы помогают регулировать плодородие почвы и делают землю пригодной для жизни перед лицом меняющегося климата», - сказал Карини.
Хотя микробные сообщества почвы оказались менее разнообразными, чем считалось ранее, они все же довольно разнообразны, по словам Стрикленда. В одном грамме почвы живут тысячи видов микробов, из-за чего Стрикленд считает почву «тропическим лесом для бедняков».
Комментировать/Поделиться
Поделиться
Оставить комментарий…